设为首页收藏本站
开启辅助访问
切换到窄版

 找回密码
 注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
查看: 367|回复: 0

[华人学者] 王博,意大利特伦托大学分子生物学博士,现从事三代测序SMRT单分子实时测序

[复制链接]
发表于 2016-7-7 01:53:55 | 显示全部楼层 |阅读模式
姓名:王博
出生时间:1986-04-28

头衔:意大利特伦托大学(Università degli Studi diTrento)分子生物学博士

研究领域:
主要从事分子生物学领域研究工作,基础分子生物学基因功能研究以及转录调控分析。博士留学期间对模式植物拟南芥(ArabidopsismiRNA的转录调控以及抗性基因的筛选验证方面进行了大量的工作并发表多篇高水平论文。 2015年底回国后加入天津湖滨盘古基因公司,从事三代测序(SMRT单分子实时测序)工作。领导并完成真菌基因组,藻类基因组,逆境植物基因组,肺癌细胞基因组,肝癌细胞转录组,家蚕细胞转录组等测序工作。同时也参与相关项目的实验方案制定,项目实施,质量监控以及沟通报告。工作期间,引入实验室规范化操作流程,优化实验方案,显著提高测序质量以及测序仪负载量,并结合自身分子生物学背景,创新设计多套实验方案以及下游实验流程,提高项目的整体质量以及完整性,并有5项专利在申请中。

基因实验室王博博士(左一)向世界绿色设计论坛京津冀绿色发展大会代表讲解

基因实验室王博博士(左一)向世界绿色设计论坛京津冀绿色发展大会代表讲解

“桑树基因组测序”项目

“桑树基因组测序”项目

所在学校及实验室:盘古基因东丽湖基因测序平台天津国际生物医药联合研究院
    盘古基因东丽湖基因测序平台是一家专业从事第三代测序技术服务的科技平台,同时也隶属于天津国际生物医药联合研究院第三代测序中心、天津大学人类基因组中心、东丽湖基因测序平台。目前已实装第三代基因测序仪(PacBio RS II)4台,可开展各类细菌,真菌,动植物等全基因组转录组及差异基因检测服务。
目前平台团队拥有诺贝尔奖金获得者1名,美国科学院院士1名,中国院士2名,国家“千人计划”2名,973首席科学家1名,国家“杰出青年人才”基金获得者1名,天津市“京津冀领军人才”1名。平台目前已与云南省烟草农业科学院、贵州大学农业生物工程研究院、中南大学医学遗传学国家重点实验室、中国科学院上海生命科学研究所、天津市各大医院、中科院、中国医科院、中国农科院、华大基因、国家超级计算机天津中心、美国哈佛大学等单位签订合作协议,从事大型基因组测序标本的获取、三代测序工作以及测序数据的分析,完整构成目前世界上最大的第三代测序中心平台。平台致力于全基因测序工作,在肝癌肺癌等癌症细胞的基因组转录组的测定分析、亲子鉴定、个体识别、基因档案、父系鉴定、母系鉴定、种族鉴定、种属鉴定、传染病毒的测定及胎儿遗传缺陷的分析等方面进行了大量研究和推广工作,对个性化诊断治疗和未来疾病的预防做出贡献。基因测序诊断技术应用广泛,目前已被应用于疾病检测、遗传鉴定、医疗卫生、农牧业、食品工业、新能源开发等多个领域,创造了巨大的经济效益并成为各方关注的焦点。在医学健康领域,可用于重大疾病早期诊断、单基因病基因检测、无创产前基因检测等,并有望为肿瘤的治疗提供个性化解决方案,实现未来个体化的基因健康管理。
    2015年12月平台引进了王博博士团队加盟东丽湖基因测序平台,负责平台基因实验室工作。

主页:http://www.tjab.org
         http:// www.pangugene.cn

盘古东丽湖测序平台

盘古东丽湖测序平台

联系方式(Email):
logo-wang@163.com

主要成就(论文和科技成就) :


1、基于二代测序技术完成十字花科植物以及生物燃料优势物种Arundo donax(芦竹)的转录组高通量测序工作,发表高水平论文2篇,同时对模式生物拟南芥的miRNA168a基因启动子的转录调控研究,并对参与其转录调控的转录因子AtTCP7进行了深入的分子生物学基因功能研究以及对抗逆功能基因CBF的转录调控研究,和新型抗逆功能基因的筛选和验证,投稿高水平论文2篇。
2、基于三代单分子实时测序技术(SMRT),设计出新型转录组分析方法,并在此方法基础上获得真菌以及昆虫细胞中新RNA病毒的基因序列,拟申请相关专利5项。

实验室拥有四台第三代测序仪

实验室拥有四台第三代测序仪

实验室四台测序仪

实验室四台测序仪

服务器

服务器
  
专著或论文名称
  
  
发表时间
  
  
发表载体
  
  
发表作者
  
  
Plastome organization and evolution of  chloroplast genes in Cardamine species adapted to contrasting habitats.
  
  
2014
  
  
BMC  Genomics
  
(if=4)
  
  
第2作者
  
  
Dissection of early transcriptional  responses to water stress in Arundo donax L. by unigene-based RNA-seq.
  
  
2016
  
  
Biotechnol  Biofuels.
  
(if=6)
  
  
第2作者
  
  
Functional  analysis of Arabidopsis thaliana Class I TCP genes AtTCP7 and  its roles in plant development.
  
  
2016(投稿)
  
  
BMC plant  biology
  
(if=4)
  
  
第1作者
  
  
The  identification of the core cis-transcriptional elements of CBFs in  arabidopsis thaliana.
  
  
2016(投稿)
  
  
Journal of  experimental botany
  
(if=5.5)
  
  
第1作者
  
  
Functional divergence among silkworm  antimicrobial peptide paralogs by the activities of recombinant proteins and  the induced expression profiles
  
  
2011
  
  
PLoS One
  
(if=3)
  
  
第6作者
  

其他介绍(主要事迹等):

   
    团队主要从事细菌,真菌,动植物等各物种基因组转录组的三代测序分析工作,同时依托于完善的分子生物学实验技术手段以及生物信息分析手段,对三代测序的实验流程进行优化和改进,准确获取高质量的序列信息,同时对后续数据进行分析挖掘,设计下游检测实验,完善基因功能信息,以及研发相应的产品检测试剂。王博士团队的加盟,极大地提升了平台基因实验室的科技水平,团队负责人王博,2011年9月至2015年9月,于意大利埃德蒙德马赫基金会(Fondazione Edmund Mach)圣米凯莱农业研究所从事博士研究工作,并获分子生物学博士学位,于国内外发表论文多篇。团队其余6名成员,均获得分子生物学类硕士以上学位,韩薇,2015年硕士毕业于中南大学;赵星宇,2015年本科毕业于江苏科技大学;段晨雪,2015年硕士毕业于天津科技大学。冯建华,2015年硕士毕业于天津科技大学;邵明辉2015年硕士毕业于天津商业大学;聂康林,2015年硕士毕业于天津大学。整支团队博士学位以上占30%,硕士学位以上占90%。整支团队的科研技术水平强,加入平台以来,解决了盘古基因实验室长期以来存在于分子生物学实验方面的困难和瓶颈,显著的提高了测序的整体质量和仪器维护运转速率,高效准确的完成了多个大基因组项目的测序分析工作。
平台基因实验室拥有国际上最先进的第三代基因测序仪(PacBio RS II)4台,超高速离心机2台,Bluepinpin核酸筛选工作站系统1套,凝胶检测成像系统1套,Qubit核酸定量分析仪1台,K5500蛋白检测仪1台,超低温冷冻冰箱1台,超净工作台2台, 以及分子生物学配套实验仪器系统等。可联合开展大型基因测序服务,基因扩增克隆检测,样品核酸蛋白质量检测,以及下游靶基因鉴定检测等。基因实验室拥有项目研发、成果转化资金500万元,并根据实际情况,平台将陆续投入后续资金。
基因实验室2015年先后开展了黑胫病、白血病、烟草基因组、杜仲基因组等测序服务, 2016年基因实验室将陆续开展,人类肝癌,肺癌,乳腺癌,十二指肠癌等癌症细胞的全基因组转录组测序工作,以及多个大型合作项目,如藻类基因组测序,逆境环境中植物基因组测序,多种花卉的全基因组测序,昆虫基因组测序以及深海植物样本的全基因组测序等一系列的工作。









王博 博士

王博 博士
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

QQ|申请友链|小黑屋|手机版|Archiver|生物信息学论坛 ( 蜀ICP备09031721号  

GMT+8, 2017-1-22 22:17 , Processed in 0.118145 second(s), 29 queries .

Powered by Discuz! X3

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表