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Hi-C 数据 怎么处理得到Hi-C的接触矩阵

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发表于 2016-7-18 09:14:47 | 显示全部楼层 |阅读模式
Hi-C数据是fastq格式文件,怎么处理可以得到接触矩阵。有做过的吗,求教!谢谢
发表于 2016-9-20 14:20:53 | 显示全部楼层
目前 处理 三维基因组数据虽说 有较多的方法,但我发现有些方法 不成熟。有个 叫 Homer的软件包,里面有详细的处理教程和整个分析流程。
http://homer.salk.edu/homer/interactions/,挺强大的。
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