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2017.4.12-15 实用微生物组学信息分析精品班

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发表于 2016-9-27 15:05:15 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 bcc-peixun 于 2017-1-5 17:42 编辑

实用微生物组学信息分析精品班
    为帮助各领域广大科研人员解决从方案设计、数据解读、图表绘制、数据挖掘和文章设计各环节中遇到的问题。北京市计算中心特聘请XX一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程,为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到70%,整套课程教学目的明确,从微生物组学实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、物种注释到数据分析和结果呈现整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加!
主办单位: 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
                 中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
                 北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
                 中国生物工程杂志
                 北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
培训时间:2017年4月12-15日  (报名中)
上课时间:上午:9:30 - 12:00   下午:1:30 – 5:00
日期
授课题目
授课内容
第一天
微生物组学研究概论及进展
1、微生物组研究的发展历史
2、微生物测序分析技术及实验技术原理;
3、研究热点分享
经典案例分享与方案设计
1、微生物组学经典文章回顾,未来微生物组学发展方向
2、已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案
第二天
Linux基础操作
1、Linux常用命令使用和上机操作;
2、Linux环境下软件安装
16s测序分析结果解读
1、OUT分析
2、物种分类与丰度分析
3、Alpha多样性分析
4、Beta多样性分析
5、显著性差异分析
16s数据分析
(上机)
1、质控与数据拼接
2、OTU聚类
3、物种注释
4、统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。
第三天
基因组测序分析结果解读
1、物种注释分析
2、差异物种分析
3、差异基因分析
4、功能注释分析
5、MGS分析
宏基因组数据分析(上机)
1、质控
2、拼接组装
3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等
4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等
5、功能注释:RAMMCAP;blast
6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)表达分析
第四天
R语言基础及R语言绘图
1、R语言简介、功能及基本语法介绍;
2、R数据处理,对R语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围;
3、R语言绘图,绘制常见的图表(散点图、条形图、文氏图、饼图、盒形图、频率直方图及热图等的绘制)
文章写作经验介绍
1、方案设计经典思路分享
2、文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【讲师团队】
邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
【报名费用】  注册费: 3500元/人(资料费、上机费、午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。
【付费方式】 现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937  
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注上单位名称)  
【报名优惠政策】

1、3.10日前报名成功并缴费每人可优惠300元
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额              
  培训座位按收到报名表先后顺序安排。   
【联系咨询】
于老师   010-59341771,QQ号:2814500767
员老师   010-59341773,18701529461, 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

实用微生物组学4.12-15.jpg

报名表.doc

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报名表填写完整后发送到邮箱 yurt@bcc.ac.cn 或QQ 2814500767

报名表.doc

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