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linux下蛋白质同源建模软件Modeller安装使用

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发表于 2011-4-18 11:23:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
1、下载网址:http://salilab.org/modeller/ ,最新版本是Modeller 9v8,下载Linux (32-bit RPM) 软件包,需要学术邮箱注册获取Modeller license key:XXXXX
安装时在终端根用户下输入:
  env KEY_MODELLER9v7=XXXXXX rpm -Uvh modeller-9v8-1.i386.rpm
2、build_profile.py搜索模板
3、salign.py产生多重序列比对
4、align2_muli.py比对模板
5、modeller_mult.py模型构建
6、evaluate_model.py模型评估
Modeller的程序模板都是python编的,用的时候需要修改脚本,不过很简单,只要把输入、输出文件参数改变就可以用啦^_^
希望对大家有用
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