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关于.cel与.chp文件的问题

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发表于 2011-8-1 14:36:49 | 显示全部楼层 |阅读模式
你好,我现在手头上有一份affymetrix的数据,而我最想要的是genotype的数据,但不知怎么把我想要的数据找到?

我的数据格式是.cel与.chp,我把它们用R读了进去,发现:

(1).cel里面有四个子文件,分别是HEARDER,INTENSITY,MASKS,OUTLIERS, 而INTENSITY里面是MEAN,STDEV,NPIXELS. 但读不懂里面的数据内容。

(2).chp里面的内容主要是是:genotype.call, genotype.confidence,genotype.probenames. 感觉这个文件会

含有我最想要的genotype的数据,但找不到。而genotype.call是数字来的,分别是6,7,8,11,它们代表什么呢?它跟我想要的genotype数据有关系吗?

请有处理过这两个文件类型数据的指点一下?

非常感谢!
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