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菜鸟求助

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发表于 2011-8-28 11:22:52 | 显示全部楼层 |阅读模式
因为我本科时是学计算机的,现在学的是生物信息学,所以很多生物知识根本一窍不通。最近读论文遇到一个问题就是对于alignment的理解有偏差。我自己上网查了一些资料,发现一种说法是联配,共分为三种①global alignment 全局联配②local alignment 局部联配③gap penalty 空位处罚。可是今天问另一个人说alignment是指序列间的比对。这个应该是指对序列间相似性的比较吧,那联配和比对有什么区别呢?还有就是看到一篇文章中提及一个词 structure of multiple RNAs,RNA不是单链吗,multiple指多重,多倍。那这个多重,多倍是指的RNA哪里的多倍?希望哪位高人能指点一二,现在真是读文章读的很混乱,或者推荐一些基础教材也行,非常感谢{:3_52:}
发表于 2011-8-28 17:32:13 | 显示全部楼层
第一个问题,就是指序列相似比较的意思,你查的和别人说的都对,


你可以看看分子生化学的书
 楼主| 发表于 2011-8-28 18:10:54 | 显示全部楼层
第一个问题,就是指序列相似比较的意思,你查的和别人说的都对,


你可以看看分子生化学的书
生物信息学 发表于 2011-8-28 17:32
好的, 非常感谢{:3_52:}
发表于 2011-8-29 15:24:19 | 显示全部楼层
nis30
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