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The Scientist:2011.6.15-7.15 F1000基因组学和遗传学七大新闻

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发表于 2011-9-23 09:59:57 | 显示全部楼层 |阅读模式
1. 一种发光的基因标签:小型单线态氧制造者

因在开发绿色荧光蛋白(green fluorescent protein, GFP)上的贡献,Roger Tsien 分享了2008年诺贝尔化学奖。如今,他的实验室构建的一种新的基因编码的荧光蛋白肯定会在电子显微镜领域引发变革。从拟南芥中制造的这种荧光蛋白,小型单线态氧制造者(mini Singlet Oxygen Generator, miniSOG),比GFP尺寸大小的一半还要小,能够结合到一系列性质人们已经了解得很清楚的蛋白质,从而可以可靠地标记各种类型的哺乳动物细胞以及完整无缺的啮齿目动物和线虫中的细胞。

X. Shu, et al., “A genetically encoded tag for correlated light and electron microscopy of intact cells, tissues, and organisms,” PLoS Biology, 9:e1001041, 2011.



2. 意外发现新的分子伴侣Spy

研究人员在测试基因工程菌大肠杆菌体内使得不稳定的蛋白质稳定化的过程中,偶然间发现一种新的蛋白分子伴侣Spy,而且该分子伴侣能够抑制蛋白聚集并辅助蛋白重折叠。Spy的塑造不同于其他任何以前研究过的分子伴侣,它能够多达700倍地增加一组不稳定的蛋白突变体的稳态水平。

S. Quan, et al., “Genetic selection designed to stabilize proteins uncovers a chaperone called Spy,”Nat Struct Mol Biol, 18:262-69, 2011.



3. 全局基因表达

采用一种称作平行代谢脉冲标记(parallel metabolic pulse labeling)的技术,研究人员测量了5000多个哺乳动物基因的mRNA和蛋白丰度及其周转速度,因而也是迄今为止第一次在基因组范围内预测mRNA和蛋白质的合成速率。这些结果表明细胞中的蛋白质丰度主要是在转录水平进行调控的。

B. Schwanhäusser, et al., “Global quantification of mammalian gene expression control,” Nature, 17:708-14, 2011.



4. 即便发现蛋白Smad的新特性,也要继续开展研究

Smad蛋白,能够调控特异性基因的转录而且在一系列microRNA的转录后诱导上也发挥着作用,然而它们是一种令人难以理解的方式发挥着功能。但是,如今,研究人员揭示了一种它们如何调控特异性microRNA的分子机制---通过结合到许多参与其中的RNA含有的一段共有序列(consensus sequence)。

B.N. Davis, et al., “Smad proteins bind a conserved RNA sequence to promote microRNA maturation by Drosha,” Mol Cell, 39:373-84, 2011.

译者注:原文中本段的标题为“Get Smad, get even”,说实在话,难翻译啊,不得其道,后来想象是不是有类似的俗语,结果发现真有,为“Don’t get mad, get even”,意思就是不要生敌人的气,这会影响你的判断,你要做的就是扳平,报复,雪恨。所以,在这里,“Get Smad, get even”,意思应为,“即便得到蛋白Smad,也要进行报复下去”,再结合原文稍加意译一下,即为“即便发现蛋白Smad的新特性,也要继续开展研究”。当然,这是我个人的意见,也望大家指点。



5. dna修复分子的空间舞步

蛋白Mre11和Rad50参与DNA双链缺口的检测和修复。如今,研究人员第一次揭示了包含Mre11和Rad50的蛋白复合体的晶体结构。

H.S. Lim, et al., “Crystal structure of the Mre11-Rad50-ATPgammaS complex: understanding the interplay between Mre11 and Rad50,” Genes Dev, 25:1091-04, 2011.



6. 染色质,DNA损伤应答和细胞死亡

当癌基因被激活时,细胞作出反应,增强它们的DNA损伤应答(DNA damage response, DDR),进入衰老状态,这很可能是作为一种抑制肿瘤的形式。但是当它们填满异染色质时,异染色堆积会带来复制压力,它们会关闭DNA损伤应答而保持活力。研究人员已经发现共济失调毛细血管扩张症和Rad3相关性(ataxia telangiectasia and Rad3-related, ATR)激酶途径调控异染色质产生,是这种DNA损伤应答转换的关键,而这部分知识有可能用于治疗一些类型的癌症。

R. Di Micco, et al., “Interplay between oncogene-induced DNA damage response and heterochromatin in senescence and cancer,” Nat Cell Biol, 13:292-302, 2011.



7. 细胞年轻的分子源泉?

大多数复杂性有机体的细胞有能力从根本上复位它们的年龄,是通过细胞分裂成配子(gamete)的方式进行的,而且这些配子会相互结合产生新的有机体。如今,研究人员已确定至少一种分子组分---酵母NDT80基因---使得这种能力成为可能。在没有正在进行配子发生的酵母细胞中短暂表达NDT80基因也能够使得它们的寿命复位。

E. Unal, et al., “Gametogenesis eliminates age-induced cellular damage and resets life span in yeast,” Science, 332:1554-7, 2011.



F1000基因组学和遗传学七大新闻 (Top 7)是在2011年7月15日计算出来的过去30天基因组学和遗传学及其相关领域方面的评级最高的论文的简要总结。F1000成员们在他们的研究领域对最重要的论文作出评价并评级。如果想要去看看最新的评级情况,可以搜索数据库,阅读每天的评价结果,具体情况访问http://f1000.com.
翻译者towersimper
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