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中国高通量测序仪现状调查

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发表于 2011-11-24 17:12:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
中国高通量测序仪现状调查
(2011年5月30日)

近日,英国两名学者(James Hadfield和Nick Loman)绘制了高通量测序仪在全世界的分布图。

根据他们的统计,目前全世界总共购买了1599台高通量测序仪(包括第二代和第三代),分布在527个研究中心,平均每个中心拥有3.0台测序仪。

若按照国家来统计,毫无疑问美国是最多的,拥有702台,遥遥领先于其他国家,其次便是中国,拥有199台,英国以132台位列第三。之后是德国、加拿大、澳大利亚、西班牙、韩国、法国、日本。让人意想不到的是,台湾也拥有22台高通量测序仪,超过香港的13台。


与美国的分布广泛不同,中国的高通量测序仪主要集中在三个地区:深圳、北京和江浙沪地区。深圳华大基因不愧为全世界规模最大的基因组学研究中心,拥有166台高通量测序仪,占全国80%以上,也是全世界拥有最多高通量测序仪的基因组中心,领先于美国哈佛-麻省的Broad研究院(114台)。其中,Illumina HiSeq 137台,SOLiD 27台,Roche/454 1台,Ion Torrent 1台。


在北京地区,北京基因组研究所拥有15台高通量测序仪,分别为:9台SOLiD 3/4、5台Illumina GA2和1台454;而北京贝瑞和康生物技术有限公司也拥有2台测序仪,分别为Illumina的GA2和HiSeq,这家公司提供测序和产前诊断业务。


在江浙沪地区,上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心拥有4台SOLiD 4/5500、2台Illumina GA2和1台454;而康成生物拥有1台Illumina GA2;浙江大学也拥有1台Illumina GA2;苏州众信生物技术有限公司拥有2台SOLiD、1台Illumina HiSeq和1台Illumina GA2;苏州生物医药创新中心也拥有Illumina的测序仪。


就各测序平台的销售情况而言,Illumina无疑是最大的赢家,总共售出了627台Genome Analyzer 2和367台HiSeq 2000。ABI售出296台SOLiD,而罗氏454售出262台测序仪。这些数据也与Frost & Sullivan的统计结果基本相符,根据Frost & Sullivan对2010年NGS市场份额的统计,Illumina占69%,Life Tech占16%,Roche占15%。


当然,这些数据也不是非常准确,仅供大家参考。据生物通所知,中山大学也有一台454的测序仪,而北京毅新兴业公司也新引进了6台Illumina GAIIx测序仪和2台Polonator测序仪。另外根据Illumina华中地区代理商介绍,武汉生命之美科技有限公司于2011年6月份成功引进一台Illumina Genome Analyzer II 高通量测序仪,是中国的第200台测序仪。
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