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请教 BioPerl

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发表于 2012-3-1 21:42:40 | 显示全部楼层 |阅读模式
最近开始学习BioPerl,linux 上已顺利安装,但是用到里面的模块是就会报错。例如:

#! /usr/bin/perl -w

use Bio::Seq;
use Bio::SeqIO;

$seq_obj = Bio::Seq->new(-seq => "aaaatgggggggggggccccgtt",-display_id => "#12345",-desc => "example 1" );

$seqio_obj = Bio::SeqIO->new(-file => '>sequence.fasta',-format => 'fasta' );
$seqio_obj->write_seq($seq_obj);


我是试着运行您的一些代码是报出如下错误:
Replacement list is longer than search list at /usr/local/share/perl/5.12.4/Bio/Range.pm line 251.

而且 USE 多个BIOPERL时都出现这个相同的问题,而且运行模块中的源代码时候也报出同样的错误。那一行的代码是   $val =~ tr/-/-1/;

我刚装的BIOPERL  不知道是没装好还是模块编写有问题还是?
盼望高手给于指导,万分感谢
盼回复
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