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紧急求助!!!!!!!

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发表于 2012-3-18 20:18:51 | 显示全部楼层 |阅读模式
花了好几天才弄清楚EST_trimmer 是什么然后在电脑上安装了perl 并下载了est_trimmer 脚本,前面说的语法为 est-trimmer.pl <fastafile> -amb=2,50 -tr5=T,5,50 -tr3=A,5,50 -cut=100,700    后面举了个例子:
est-trimmer.pl ESTs -amb=2,50 -tr5=T,5,50 -tr3=A,5,50 -cut=100,700     请问下  我有个EST序列的文件 ESTsequence.fasta   如何输入命令让这个est_trimmer 脚本处理这个文件里的序列?     已经在网上搜了好几天了  找不到方法,特来此求助,求好人帮忙~~~~~~~~好人有好报
发表于 2012-3-22 19:35:34 | 显示全部楼层
perl  程序所在路径/est-trimmer.pl 序列文件路径及文件名 -amb=2,50 -tr5=T,5,50 -tr3=A,5,50 -cut=100,700     
应该就是这样吧
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