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我国初步完成毛竹基因组测序研究

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发表于 2012-3-24 20:15:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
目前,由中国林科院林业研究所、国际竹藤中心与中国科学院国家基因研究中心共同承担的毛竹基因组测序研究200704001)项目取得重大进展。
毛竹是世界上最重要的竹类植物之一,开展毛竹全基因组测序及后基因组研究,对全面掌握禾本科植物基因组信息,了解竹类植物生物学特性的遗传学基础具有重要意义。
科技创新加速基因组序列测定与组装。项目克服了毛竹基因组大(水稻的5)、多倍体、重复序列多等困难,采用SOLEXA测序技术,并创新了BAC测序技术和序列组装策略,实现了对毛竹全基因组高覆盖率的深度测序。目前,毛竹基因组随机测序已完成近200 Gb的测序量,基因组序列组装后总长可达1.91 Gb,覆盖了90%的基因组序列,超额完成了预期目标。
首次成功构建毛竹cdna数据库。项目建立了以毛竹为主的竹子cDNAEST序列数据库——毛竹cDNA数据库Moso bamboo cDNA database,简称MBCD),这是世界上第一个竹子基因组数据库,它的建立为我国全面开展竹子基因组学研究搭建了一个优势平台。
通过对MBCD数据库进行多基因系统进化分析,发现竹子与其最接近的物种——水稻的平均分化年龄是2800万年,即可能在2800万年前,竹子从水稻中分化出来,并获得新的基因,随着基因组序列信息的不断获得,相信不久将从分子生物学的角度对毛竹四倍体的形成机理予以解释。
    毛竹基因组测序是中国继参与完成人类基因组、水稻基因组计划后,第一个由我国科研人员自主发起的重大基因组计划。该项目的重大成果,将对毛竹和其他竹类植物的遗传改良、基础生物学研究和进化研究具有重要的推动作用。
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