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去除重复序列的方法

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发表于 2012-11-26 21:13:01 | 显示全部楼层 |阅读模式
各位,好!
     谁知道在众多的序列中去除重复序列的方法?最好有软件。perl语言之类的我不会。另外,我分析的序列较多,有5万左右,有谁知道有什么软件。谢谢
发表于 2012-11-27 14:51:08 | 显示全部楼层
用blast吧,blast用好了能干很多事,不仅仅是序列比较
 楼主| 发表于 2012-11-27 22:09:13 | 显示全部楼层
你好,你说的是本地Blast吧?能给详细的参数吗?谢谢! 2# 生物信息学
发表于 2012-11-30 14:15:03 | 显示全部楼层
blastclust blast聚类啊,5万多,其实用默认参数就行,把聚类结果复制到Excel表,取最前面的的一列,再用fastacmd提取序列就可以了
发表于 2013-1-7 18:11:52 | 显示全部楼层
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