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《重测序数据分析专题培训》——北京市计算中心

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发表于 2014-2-20 10:02:46 | 显示全部楼层 |阅读模式
重测序专题研讨班通知
——实用生物信息学系列专题班
通过全基因组重测序的序列比对,研究者可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(CNV)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)等变异位点。并通过对已知全基因组序列的物种进行测序,来研究个体或群体间的相关变异信息,从而找出与疾病、性状、以及功能有关的基因,进行个体或群体分子水平的差异分析。随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升,再加上已知基因组序列的物种增多,全基因组重测序已成为动植物物种遗传差异研究、功能基因挖掘等最可靠的方法。为了更好的服务于广大科研工作者的需要,北京市计算中心生物计算事业部举办“重测序”专题研讨班。每期名额有限,欢迎您参加!
主办单位:北京市计算中心
培训地点:北京海淀区丰贤中路73号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间 2014年4月2-4日
本次课程时间:   上午:9:30-11:30下午:13:30-16:30
  
日期
  
授课题目
授课内容
第一天
重测序研究背景及理论
Ø   生物信息学知识背景概述;
  
Ø   二代测序的基本概况和技术发展简介;
  
Ø   重测序的基本概念、研究历史、内容和意义;
  
Ø   重测序研究策略以及技术、前沿热点及趋势;
Linux上机操作及生物信息学软件安装
Ø  linux基础基本操作;
  
Ø  生物信息学软件应用及常用软件介绍、重测序相关分析软件介绍及安装;
第二天
动物、植物、微生物重测序的案例分析应用及分析流程(个体水平)
Ø   动物重测序理论与案例分析;
  
Ø   植物重测序理论与案例分析;
  
Ø   微生物重测序理论与案例分析;
重测序分析上机练习(以细菌和植物为例)
Ø   重测序的分析流程;
  
Ø   原始测序数据的质控及过滤;
  
Ø  学习bwa,samtools,pindel等工具的使用,进行calling SNP、INDEL、SV,变异注释及功能分析;
第三天
重测序(外显子组测序)在群体遗传学中的应用(群体水平)
Ø   群体遗传学理论:
  
Ø   进化分析;
  
Ø   GWAS分析;
群体水平测序数据分析实例
  
(上机操作)
Ø   混池重测序的进化分析流程;
  
Ø   孟德尔疾病的外显子组测序分析流程;
  
Ø   低覆盖度重测序与缺失基因型填充(Imputation)分析流程;
  
Ø  复杂疾病的重测序GWAS分析流程。
(课程内容以实际授课为准)
报名费用  注册费:工作人员3000元/人、学生2500元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937  
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注上单位名称)
如需发票请注明发票抬头,培训结束后统一开具发票(培训费、注册费、会议注册费、技术服务费、信息服务费等),有其他特殊要求请声明。
报名优惠政策
1、3.1日前预报名的学员每人可优惠400元,
开课前20天报名的学员每人可减少200元,
开课前10天报名的学员每人可减少100元。
   2、2人团报每人可减免200元,3人以上团体报名每人可减少400元;
   3、4+1团报,可免费赠送一个名额                 
   4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
   5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
注意事项
1、       已经成功付款的学员,如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。
2、       撤销席位后,学员可提交延期申请,可参加当前时间到2013.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。
报名截止:2014年4月1日
请联系:小张 010-59341771,18618295767,QQ号:2814500767,
邮箱zhangly@bcc.ac.cn
小员 010-59341773,18701529461,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn
报名回执表:
  
培训班类型:(可多选)
  
□实用生物信息学培训班   □科研论文绘图研习班 □重测序专题研习班
  
宏基因组分析专题研讨班  □Perl语言专题班  □转录组专题研习班
姓名:
性别:
民族:
职称:
身份证号
工作单位:
住宿:
是□;否□
研究方向:
报名时间:
通讯地址:
邮编:
固定电话:
手机
E-mail:
对课程了解情况
☆☆☆☆☆
感兴趣的课程:
信息渠道:
□中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□海报  □单页 □销售员  □丁香园  □生物论坛  □生物通邮件   □生物360  □朋友推荐               
发票抬头:
发票内容:
住宿明细
入住时间:
  
离店时间:
房间类型
□大床间
  
□标准间(和       合住)
  
□拼房(与其他学员拼标准间)
备注:
确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认。

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