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《转录组学数据分析专题培训》

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发表于 2014-2-20 10:08:33 | 显示全部楼层 |阅读模式
转录组学专题研讨班通知
——实用生物信息学系列专题班
近年来,随着高通量测序技术的迅猛发展,转录组研究从以前的微阵列技术,SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。RNA-seq对于真核生物的基因表达调控,癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定,遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,北京市计算中心生物计算事业部举办“转录组学”培训研习班。
主办单位:北京市计算中心
培训地点:北京海淀区丰贤中路73号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间2014年5月8-10日
本次课程时间:   上午:9:30-11:30下午:13:30-16:30
  
日期
  
授课题目
授课内容
第一天
转录组测序与数据分析
1、 转录组基本概况和技术发展简介
  
2、 转录组技术流程及技术细节(重点讲解)
  
3、转录组应用案例
转录组数据分析实例(上机操作)
1、linux基础
  
掌握Linux系统下的常用命令(重点)
  
掌握linux环境下软件的安装使用
  
了解shell脚本的编写
  
2、转录组数据准备和软件介绍
  
3、 转录组数据的比对(重点讲解)
  
4、 表达量估计和分析(重点讲解)
第二天
转录组组拼接及功能注释
1、 转录组序列拼接的技术方法
  
2、 常用软件及转录组个性化组装的技巧
  
3、 使用R语言相关的软件包对转录组学的高通量测序数据进行分析。讲解差异表达分析,GO分析,Pathway分析,聚类分析等。
  
4、 讲解如何绘制表达量的热图等
转录组拼接组装(上机操作)
1、转录组组装的流程介绍
  
2、原始测序数据的预处理
  
3、介绍Trinity的使用,并以测试测序数据为例进行组装
  
4、介绍cdhit的是使用,并以测试组装结果为例进行聚类
  
5、介绍寻找ORF的方法
第三天
microRNA测序与数据分析
1、 microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义
  
2、 microRNA的生物学过程(重点讲解)
  
3、 microRNA的测序(重点讲解)
  
4、 microRNA测序数据分析软件(重点讲解)
  
5、 microRNA目前的挑战以及将来的研究前景
  
6、 microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)
  
7、 近期文献
microRNA数据分析实例(上机操作)
1、 microRNA测序数据预处理(重点讲解)
  
2、 测序数据长度分布计算
  
3、 microRNA的预测(重点讲解)
  
4、 microRNA碱基偏好性计算
  
5、 microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)
(课程内容以实际授课为准)
报名费用  注册费:工作人员3500元/人、学生2000元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937  
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)
如需发票请注明发票抬头,培训结束后统一开具发票(培训费、注册费、会议注册费、技术服务费、信息服务费等),有其他特殊要求请声明。
报名优惠政策
1、4.1日前预报名的学员每人可优惠400元,
开课前20天报名的学员每人可减少200元,
开课前10天报名的学员每人可减少100元。
   2、2人团报每人可减免200元,3人以上团体报名每人可减少400元;
   3、4+1团报,可免费赠送一个名额                 
   4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
   5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
报名截止:2014年5月7日
请联系:小张  010-59341771 ,18618295767,QQ号:2814500767,邮箱zhangly@bcc.ac.cn
小员  010-59341773,  18701529461 ,   邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

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