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[交流] 有关软件的几个问题

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发表于 2011-2-21 10:37:02 | 显示全部楼层 |阅读模式
各位大侠好,学习生物信息学没多久,最近在用有关软件的过程中发现许多问题,在此向各位高手请教一下,还望高手们不吝赐教!谢谢!
1,我用perl将我要进行进化分析的序列分好类型之后进行序列比对时,我用的是clustal x 软件,我的序列数目比较多,每个文件都有2000多条,但是发现这个软件不是那么好用,很慢,有人给我推荐用muscle,但是我还没试,请教各位有没有什么好的建议?
2,有关序列比对之后怎么看结果的问题,我知道一个是aln文件一个是dnd文件,我需要找同源性较高的序列,应该怎么做?求一般的看结果的步骤和方法。
3,有关进化树的的介绍
谢谢!
 楼主| 发表于 2011-2-21 13:23:14 | 显示全部楼层
这个论坛确实有点冷,人太少了呀!
发表于 2011-2-21 19:52:55 | 显示全部楼层
发表于 2011-2-21 19:54:28 | 显示全部楼层
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